在肯定上海公司注冊行為屬于行政行為的前提下，就該行為到底是何種行政行為，學(xué)界主要存在兩種不同觀點，一是行政許可說，一是行政確認(rèn)說。行政許可說認(rèn)為注冊上海公司是一種行政許可行為，是上海公司注冊機關(guān)賦予公司企業(yè)法人主體資格和一般營業(yè)能力的設(shè)權(quán)性具體行政行為。行政許可說是目前我國學(xué)界的主流觀點。行政確認(rèn)說認(rèn)為上海代理注冊公司是一種行政確認(rèn)行為，是登記機對公司法人主體資格和一般營業(yè)能力進行確定、認(rèn)可、證明并以宣告的確權(quán)性具體行政行為。

　　首先應(yīng)當(dāng)肯定的是行政許可行為與行政確認(rèn)行為具有相同性，表現(xiàn)在兩者都屬于行政行為中的依申請的行政行為。所謂依請的行政行為，是指行政機關(guān)根據(jù)相對人喲申請才能作出的行為必須基于相對人的申請，行政機關(guān)才作出，行政機關(guān)不能主動作出行政行為。相對人的申請是行政關(guān)作出行政行為的必要前提條件行政許可和行政確認(rèn)都是必須基于相對人的申請行政機關(guān)才能作出的行政行為。但是，行差異。行政許可是指根政主體依法賦予其從事法律一般禁止事項的權(quán)利和資格的行政行為。

　　換言之，行政許可就是根據(jù)相對的申請，許可其從事某些否則就是受到限制或者禁止的事情。政確認(rèn)則是指行政主體應(yīng)相對人的申請，依法確認(rèn)其法律主體效力等。我國臺灣學(xué)者將行平政確認(rèn)行為亦稱為補充行政行為，認(rèn)為該行為是予他人之法律行為以同意，進為之行政處分。非經(jīng)認(rèn)可，法律行為不能有效成立。要區(qū)別是：

　　第一，行政許可是以律對許可事項的一般禁止為前提，許可為禁止的解除，權(quán)利的恢復(fù)；行政確認(rèn)是以法律對確認(rèn)事項的一般允許為前提，確認(rèn)是權(quán)利的認(rèn)可。

　　第二，真有廣泛的自由裁量性，行政主本對于相對人的申請，可基于社會公共利益等理由，依自由裁量予以許可或不許可；而行政確認(rèn)則具有嚴(yán)格的羈束性，行政主對于相對人的申請，只要符合法定條件和法定程序，必須予以認(rèn)可和確認(rèn)，不得拒絕，無自由裁量余地。

　　結(jié)合上海公司注冊的具體情況看，上海公司注冊機關(guān)必須根據(jù)當(dāng)事人的申請才能進行審核，并決定是否登記注冊。因此，上海公司注冊應(yīng)屬于依申請的行政行為。上海公司注冊機關(guān)對于當(dāng)事人的申請，只要符合法定條件和程序，就必須予以登記注冊，沒有自由裁量權(quán)；而且，根據(jù)公司自治原則，當(dāng)事人有設(shè)立公司、變更公司及終止公司的自由權(quán)利。

　　因此，當(dāng)事人申請上海公司注冊，不是屬于法律普禁止或限制的事項，年的事項，登記機關(guān)經(jīng)審核予以登記注冊是依法對當(dāng)事人的應(yīng)有權(quán)利的認(rèn)可和確認(rèn)?？傊虾９咀苑弦郎暾埿姓袨橹械男姓_認(rèn)行為的特性。基于此，不贊成行政許可說，而贊成行政確認(rèn)說。質(zhì)言之，注冊上海公司行為屬于應(yīng)申請的確權(quán)性（而非設(shè)權(quán)性）的行政確認(rèn)行為。

　　上海公司注冊認(rèn)識公畝己行為的確權(quán)性行政確認(rèn)行為性質(zhì)具有重一方面，它肯定了上海公司注冊的公權(quán)性，從而保障上海公司注冊的權(quán)威性和統(tǒng)一性；另一方面，它又有利于對登記機關(guān)的權(quán)力進行制，對當(dāng)事人的公司自治權(quán)利進行保護，并有利于同時實現(xiàn)上海公司注冊的安全和效率的價值取向。